L’organisation et le fonctionnement du CHU-B sont fixés par le décret n°88 /622 du 30 juillet 1988. Conformément à ce décret et autres textes subséquents, l’organisation du CHU de Brazzaville s’articule autour d’ organes de gestion, d’organes consultatifs et de services extérieurs . Le CHU-B compte six directions divisionnaires et trois services rattachés à la Direction Générale. Il s’agit de :
